Covid-19 : mise à jour du 27 mai par Le Professeur Jean-François TOUSSAINT

Jean-François TOUSSAINT  

Mise à jour du 27 mai

voici les données actualisées de l'épidémie au pas de temps quotidien, en France et dans le monde.

S'y ajoute les commentaires de deux directeurs de l'OMS chargés de son suivi lors de la conférence de presse de l'organisation, ce lundi 25 mai 2020

https://www.who.int/fr/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019

& la démonstration de la fin de cette phase en Nouvelle-Zélande : zéro décès depuis trois semaines & deux contaminations en 10 jours.

La Covid-19 ne prend donc pas de caractère endémique et l'épidémie cesse.

33 Pays et 41 Régions ou Territoires n’ont pas déclaré de décès depuis le 6 mai : 

Chine : 30 des 31 provinces (hors Jilin), Mongolie, Cambodge, Vietnam, Nouvelle Zélande, 6 des 8 provinces Australiennes, Fidji, Papouasie, Timor, Buthan, Brunei, Seychelles, Islande, Groenland, Îles Féroé, Liechtenstein, Monaco, Gibraltar, Jordanie, Gambie, Rwanda, Ouganda, Erythrée, Namibie, Zimbabwe, Île Maurice, 5 des 13 provinces Canadiennes, Bahamas, Barbade, Bermudes, Caïman, Jamaïque, Trinidad, Aruba, Sainte Lucie, Saint Vincent, Dominique, Belize. Pour la France : Polynésie Française, Nouvelle-Calédonie, Saint Barthélémy, Saint Martin, Guyane Française et Martinique.

24 Pays et 5 Régions ou Territoires ont déclaré moins de deux décès depuis le 6 mai : 

Taiwan, Thaïlande, Province chinoise du Jilin, 2 des 8 provinces Australiennes, Maldives, Sri Lanka, Ouzbékistan, Lettonie, Ile de Man, San Marin, Malte, Chypre, Albanie, Kosovo, Monténégro, Liban, Cap Vert, Togo, Bénin, Éthiopie, République Centrafricaine, Angola, Mozambique, Madagascar, Curaçao, Guyana, Paraguay. Pour la France : Réunion et Guadeloupe.

Durant les trois dernières semaines (entre le 6 et le 27 mai) 57 Pays et 46 Régions ou Territoires ont donc déclaré zéro, un ou deux décès.

Le nombre de pays qui voit la pandémie refluer augmente puisqu'il était de 44 il y a dix jours.

Tout ceci reste très encourageant.

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Mise à jour du 20 mai

Pour observer une évolution sanitaire, la mortalité est la valeur la moins incertaine dans tous les pays, quelles que soient leurs difficultés de recueil. Que la pathologie soit infectieuse ou non transmissible, les systèmes de santé et les agences de surveillance comptent moins mal les décès que les nouvelles affections, le constat étant souvent plus consensuel.

 

Le nombre de décès dus au Covid-19 dans le monde ne cesse de décroître en moyenne depuis le 16 avril.

Il décroît en cas réels depuis le 29 avril même si ce pic du 29/4 correspond à la déclaration ce jour-là d'un très grand nombre de décès survenus antérieurement dans les maisons de retraite -retirement homes- du Royaume-Uni (la France en avait fait de même quelques semaines plus tôt : ceci modifie transitoirement l’analyse statistique sans en changer la dynamique de long terme).

 

La réduction du nombre de décès quotidiens dans le monde est de 50% par rapport au 16 avril (Figure 1). Elle est de 85% en Europe (95% en Belgique et en Suisse, 85% en Allemagne et en France, 70% au Royaume-Uni) et de 60% aux Etats-Unis.

 

Lors de sa conférence de presse hebdomadaire, l’OMS a fait état hier d’une augmentation de 106 000 nouvelles contaminations dans le monde, chiffre le plus élevé enregistré à ce jour. De fait par rapport au 16 avril ce nombre a augmenté de 9% (Figure 2).

Dans son discours introductif, le directeur de l'organisation n'a cependant pas évoqué l'évolution de la mortalité.

https://www.who.int/fr/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019  -  Conférence de Presse du 20 mai 2020

Comment expliquer cette contradiction entre une maladie qui semble toucher de plus en plus de personnes mais en tue de moins en moins ?

 

Il suffit de préciser qu’il s’agit dans le premier cas du nombre de contaminations validées par des tests qui sont maintenant produits en bien plus grand nombre. Mis à la disposition et utilisés par un nombre croissant de pays, ces tests permettent d'étendre le diagnostic à des personnes parfois moins sévèrement atteintes et moins à risque de décès.

Dans l'évolution usuelle d'une pandémie, lorsque la réponse des systèmes de santé trouve son efficacité maximale, alors le nombre de cas nouveaux (l’incidence) augmente - par l'amélioration des capacités de détection - tandis que la létalité diminue. De fait, ce taux de létalité est passé de 7,18% (maximum du 29/4) à 6,61% hier et va très probablement continuer de décroitre progressivement (Figure 3). Ceci représente un très bon signe évolutif.

1. Evolution mondiale des Décès quotidiens

2. Contamination évaluée par Tests

3. Taux mondial de Létalité

Mise à jour du 17 mai

Signe d’une épidémie à l’arrêt ou en cours d’achèvement sur leur territoire, quarante-quatre pays - sur les 175 ayant connu au moins un cas de contamination humaine par le Covid - ont déclaré un ou zéro décès depuis 10 jours.

Parmi ceux-ci, quinze n’ont pas connu de décès depuis un mois.

 

Pays, Régions et Territoires n’ayant pas connu de décès depuis 10 jours : 

Trente provinces de Chine (dont le Hubei), Mongolie, Cambodge, Vietnam, sept des huit provinces Australiennes, Nouvelle Zélande, Polynésie Française, Fidji, Nouvelle-Calédonie, Papouasie, Brunei, Buthan, Sri Lanka, Seychelles, Islande, Albanie, San Marin, Liban, Libéria, Bénin, Gambie, Rwanda, Ouganda, République Centrafricaine, Namibie, Angola, Mozambique, Zimbabwe, Réunion, Madagascar, Île Maurice, sept des treize provinces Canadiennes, Guyane Française, Guadeloupe et Martinique

 

Pays, Régions et Territoires ayant déclaré un seul décès durant la dernière semaine : 

Taiwan, Thaïlande, Népal, Province du Jilin, Province Australienne de Nouvelle Galles du Sud, Maldives, Ouzbékistan, Lettonie, Ile de Man, Malte, Kosovo, Monténégro, Tunisie, Cap Vert, Togo, Djibouti, Éthiopie, Paraguay, Uruguay

 

Source : CSSE, Université Johns Hopkins

 

VIDEOS : BFM TV 14 mai

Grand oral

https://rmc.bfmtv.com/mediaplayer/video/le-grand-oral-de-pr-jean-francois-toussaint-professeur-de-physiologie-1405-1247411.html

Mise à jour du 11 mai

voici la dynamique actualisée du nombre de contaminations quotidiennes en Europe : entre le 12 avril (49 758 nouveaux cas) et le 10 mai (8962), la réduction est de 82%.

Dans le monde, l’évolution de la mortalité quotidienne (∆ Décès) montre une réduction de 68% au regard des maxima de la mi-avril, et de 44% pour les valeurs moyennes (Moy5j).

Avec deux nouveaux cas par jour et aucun décès depuis une semaine, la Nouvelle Zélande (où 150 000 personnes ont été testées pour un pays de 5 millions d’habitants) va reprendre ses échanges avec l’Australie, qui a atteint le même stade.

Enfin Johan Giesecke, ancien responsable de la santé publique en Suède explique, dans le Lancet  (https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)31035-7/fulltext#%20), le contexte de leurs décisions, les résultats sur l'immunisation des Suédois, les évolutions attendues et la notion de "soins optimaux" à l'échelle individuelle, comme à celle d'un pays

Contamination, Europe, 11 mai

Décès, Monde, 11 mai 2020

Médias :

https://www.20minutes.fr/societe/2769167-20200505-coronavirus-confinement-inutile-si-simple

https://www.bfmtv.com/mediaplayer/video/covid-le-pr-toussaint-observe-une-phase-de-decroissance-continue-dans-les-pays-les-plus-touches-1245263.html

https://www.bfmtv.com/sante/coronavirus-arrive-t-on-a-la-fin-de-l-epidemie-1909025.html

Mise à jour du 5 mai

afin que chacun puisse se faire une idée plus précise sur la dynamique de l'épidémie, je vous prie de trouver ci-joint la mise à jour du nombre de décès hospitaliers au pas de temps quotidien en France

(Données: Santé Publique France: https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections-respiratoires/infection-a-coronavirus/articles/infection-au-nouveau-coronavirus-sars-cov-2-covid-19-france-et-monde)

et le suivi du nombre de décès dans 12 pays d'Europe et du Monde

(Source: CSSE Univ Johns Hopkins: https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19/tree/master/csse_covid_19_data/csse_covid_19_time_series)

1. Décès France 6.5.20 2. Décès Monde 6.5.20

Nice-Matin : 3 mai

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Communique : 2 Mai

Avec une moyenne de 806 cas sur les 5 derniers jours le nombre de contaminations quotidiennes en métropole est,  pour la première fois depuis le 17 mars,  inférieur à  1000  par jour.

Le virus continue de réduire sa contagiosité, cette valeur ne cesse de décroitre dans la plupart des pays quels que soient les décisions assumées ou les choix établis par les états .

Deux nations d’Amérique Latine (dont le Brésil) ainsi que l'Inde progressent encore à des taux cependant 1 à 2 ordres de grandeur inférieurs à ceux des pays européens ou nord-américains

En ce 1er mai, 218 personnes sont décédées d’un coronavirus contracté dans les quatre dernières semaines et  1400 sont décédées en France d'une autre cause.

La fin de ce voyage chaotique approche: moins de 5% de cette vague reste à subir.

Pleurons nos morts, aidons nos convalescents à renaître.

Remercions celles et ceux qui n’ont ni plié, ni fui et ont tenu leur poste dans la tempête.

 

France, Contaminations

 

Log Décès, Continents 1.5.20

Communique : 28 avril

À l’échelle mondiale, la mortalité due au Covid a décru de 62% depuis le passage des sommets (de 9620 décès dans le monde au jour du pic, à 3692 hier).

En France, depuis les maxima début avril, le nombre journalier de contaminations a baissé de 60% ; le nombre de décès hospitaliers de 50%, le nombre de décès en EHPAD de 85%

Seuls trois pays sont encore en phase d’expansion dans le monde : le Brésil (320 décès quotidiens), le Mexique (80) et l’Inde (58, un taux presque 100 fois inférieur à celui qu'a connu l'Europe)

Au-delà des caractéristiques propres au virus (propriétés de l’enveloppe, mutations, protéines, …) et de nombreuses autres (saluons à ce propos la réussite en première phase de l'essai clinique Corimuno et de ses concepteurs), ces observations suggèrent aussi de mieux définir les inter-dépendances entre trois groupes de facteurs :

- démographiques : la jeunesse des populations est un facteur défavorable à la circulation de ce virus, à l’inverse le vieillissement des populations, et leur fragilité, ont été fatales

- sanitaires : facteurs de risque cardio-vasculaires, troubles métaboliques (obésité, sédentarité, diabète …), cancer, niveau d’activation immunitaire

- environnementaux : la chaleur est un facteur limitant, jouant potentiellement sur la stabilité de l’enveloppe virale ; le rôle de la pollution nécessite d’être confirmé comme il l’a été pour la propagation grippale

Ces facteurs répondent aux schémas d’interactions entre un agresseur (viral) et un agressé (populations vulnérables) dans un contexte particulier. Leur dynamique évolutive définira les conditions d’une possible saisonnalité, ou non.

Quant aux pistes de travail, la propagation Est-Ouest interroge également, d’autant qu’à l’inverse de l’Europe, le gradient longitudinal américain montre des taux de décès dix fois supérieurs dans les états de la côte Est par rapport à ceux de la côte Ouest (le maximum est atteint à New York avec 950 décès par million d’habitants, soit deux fois les taux européens les plus élevés, en Espagne et en Belgique). Les routes de la soie ont leurs inconvénients mais la climatisation des tours peut-être plus encore.

Enfin, dans le cadre d'un déconfinement prochain, l’ensemble des mesures décidées, quelles qu’elles soient,

devra être très régulièrement révisé à hauteur de la circulation virale, de sa décroissance actuelle et de son évolution.

Communique : 21 avril

Beaucoup d’entre vous me demandent où en sont les autres continents

Les analyses ci-jointes vous montreront les évolutions de :

- l’Océanie : où l’Australie, principal pays concerné, a achevé son cycle. L’épidémie y a cessé (zéro cas, zéro décès nouveaux depuis 48h, à suivre)

- l’Asie : l’épidémie en Chine semble ne plus être liée qu’aux cas de ré-importation (retour de citoyens venant de pays atteints). Hors de Chine, la Corée voit également l’épidémie s’arrêter en ce moment (dix cas, deux décès chaque jour depuis 72h). Vous noterez les données de Taiwan (422 cas cumulés pour 6 décès en tout depuis janvier) et du Vietnam (268 cas/0 décès). Tous trois ont pratiqué des politiques de contrôle issus de l’expérience du SARS 2003, avec dépistage immédiat et isolement ciblé pour les personnes malades et les sujets contacts, sans confinement de leur population. Les états européens pourraient évoluer vers ce type de mesures, d'autant que la Suède, les Pays-Bas et l'Allemagne ne montrent pas de résultat inférieur aux autres pays sur notre continent.

- l’Afrique : la principale zone d’extension a concerné les pays du Maghreb (hors Lybie, sans information certaine). Après 9 semaines de circulation, le Covid-19 y a contaminé 10000 personnes (presque la moitié des cas africains) et fait 840 victimes (70% des décès continentaux) ; le graphe 1 (en haut à droite) montre la différence de progression du total des décès cumulés (en échelle logarithmique) entre Afrique et Europe : la différence des pentes illustre l’écart de 1 à 100 entre les totaux enregistrés à ce jour ( 1190 décès en Afrique, 104 000 en Europe )

- l’Amérique du Sud (graphe 2): l'épidémie y est présente depuis le 26 février. De nombreux pays ont passé le pic de contamination, à l'exception du Brésil et de la Bolivie, et certains ont déjà passé le pic de décès; hors Brésil, les valeurs au pic de mortalité sont restées inférieures à 50 décès par jour en Colombie, Equateur, Argentine, Chili ; la mortalité moyenne du Covid est actuellement de 1 décès par jour en Bolivie, Paraguay & Uruguay

Jean-François Toussaint

Professeur de Physiologie, Université de Paris

CIMS Hôtel-Dieu, APHP   -   Review Editor AR6, IPCC / GIEC

Directeur de l’IRMES, Institut de Recherche Médicale et d'Epidémiologie du Sport

Am Sud 21.4.20 Asie Afrique Océanie 21.4.20

Asie Afrique Océanie 21.4.20

Mise à jour du 18 avril

https://www.irmes.eu/ea7329/index.php/news/sport-et-covid/

 

Les pics mondiaux de contaminations et de létalité ont bien été franchis les 7 et 9 avril 2020 : le nombre de décès en lien avec le Covid19 était alors de 95 429 dans le monde (il est de 125 871 en ce 15 avril). Les pics français ont également été passés la semaine dernière (les 5 et 7 avril). Avec 12 150 décès au 14 avril, le Royaume Uni franchit en ce moment son pic de mortalité alors que les USA l’ont passé le 11. La plupart des pays basculent donc l'un après l'autre vers une phase de ralentissement de l'expansion. Pour la Suède qui, comme les Pays-Bas, n’a pas confiné sa population, le nombre cumulé après 10 semaines d’épidémie est de 1033 décès.

Avec un taux de mortalité qui pourrait se situer autour de 0,37% (première étude populationnelle, au cœur d’une des régions allemandes initialement touchées https://www.springermedizin.de/covid-19/epidemiologie-und-hygiene/die-erkenntnisse-aus-der-coronavirus-studie-in-heinsberg/17890088), il sera intéressant de confronter ces réalités avec les prédictions qui ont fondé les décisions de confinement généralisé : le nombre total de décès avait en effet été estimé à 500 000 pour le Royaume-Uni et à 70 000 pour la Suède.

Une fois ce recadrage effectué, l’impact d'un confinement global prolongé, et de ses effets dominos, pourrait alors apparaitre sous un jour assez différent.

Prenez encore soin de vous et de vos proches

Bien à vous

Jean-François Toussaint

Professeur de Physiologie, Université de Paris

CIMS Hôtel-Dieu, AP-HP - Review Editor IPCC / GIEC

Directeur de l'IRMES, Institut de Recherche bioMédicale et d'Epidémiologie du Sport

Are we reaching the frontiers ?  -  Espoirs, contraintes et limites

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Risques et Coronavirus